شکم در برگیرنده دستگاه‌هایی مانند دستگاه گوارش، کبد، کیسه صفرا، طحال و لوزالمعده می‌باشد. مهم‌ترین کاربرد سونوگرافی شکم در تشخیص بیماری‌های کیسه صفرا است. با سونوگرافی می‌توان تورم ناشی از وجود سنگ‌ها و تومورها را تشخیص داد. برای برخی از بیماری‌های روده و معده نیز می‌توان از سونوگرافی شکم کمک گرفت، اما وجود گاز و هوای درون این قسمت‌ها مانع انجام سونوگرافی با دقت بالا می‌شود. از سونوگرافی شکم همچنین می‌توان برای تشخیص مواردی مانند التهاب آپاندیس یا آپاندیسیت استفاده کرد.

نکاتی که قبل از سونوگرافی شکم و دستگاه گوارش باید رعایت شوند: لازم است بیمارانی که تحت سونوگرافی کبد، کیسه صفرا و مجاری صفراوی قرار می‌گیرند، ناشتا باشند. مصرف غذاهای چرب مانند کره و تخم مرغ روی نتیجه سونوگرافی تاثیرگذار است، پس از ساعاتی قبل از انجام سونوگرافی نباید آن‌ها را مصرف نمود.